茵陈与艾草从药物的性状、主要功效、以及主要治疗的病症方面都存在区别。具体如下：

1、从药物的性状来看：茵陈的叶片小，味道小，一般叶片卷曲成团状；而艾草的叶片大，味道比较重，一般叶片呈椭圆形。

2、从药物主要功效来看：茵陈的主要功效包括清热利湿、利胆、降低黄疸等；艾草主要的功效为回阳、理气养血、祛除湿寒、温经止痛等，外用艾草还有祛湿止痒的作用。

3、从治疗范围来看：茵陈主要用于湿温或者暑湿、黄疸尿量少、湿疮瘙痒等病症的治疗；艾草临床用于腹痛、经寒不调、宫寒不孕、月经量过多、流鼻血、吐血、阴道流血等临床病症的治疗，还可以用于治疗妊娠期间的阴道出血，皮肤瘙痒也可以外用艾草治疗。

临床应该注意茵陈和艾草使用时，必须由专业的医生指导，不能自行用药。