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天然产物:药物发现的下一个前沿

09-07 我要评论

在本期 omg OMx 播客中,布鲁克的 Kate Stumpo 与 Enveda Biosciences 的高级科学家 Pelle Simpson 进行了对话。与他们一起讨论 Enveda Biosciences 如何利用天然产物来塑造药物发现以及天然产物在多组学领域的机遇。阅读所选摘录或观看下面的完整播客。

我通过在本科阶段学习分析化学开始了我在这个领域的旅程,在那里我有幸在几个非常酷的、杰出的实​​验室实习。在这些实验室中,我遇到了创新技术,包括重新编程和 Gilson 自动进样器,能够对蛇毒进行精确的温度调节分馏,同时还能获取质谱数据。

快进到我的硕士课程和在 CU Boulder 的任期,我​​开始涉足 3D 打印、电气工程领域,并且正在构建一些小设备来帮助自己实现自动化并加快工作速度。

2021 年初,我遇到了 Enveda Biosciences 的一位创始成员,他正在 CU 的质谱设施周围打听,看看是否可以在那里运行一些样品。当他在那里时,他看到了我的一个小创作,并想与我进一步讨论,所以我们组织了一次 Zoom 会议,接下来我知道我在 Enveda 兼职工作。

当我开始在 Enveda 工作时,实验室基本上只是一个空置的空间,墙上有几个托盘架。两年半过去了,我们已经拥有了两个完全建成的实验室,距离搬入全新设施只有两个月的时间。

从一开始,我就真正关注在复杂的天然产物混合物中精确定位生物活性化合物的问题。现在,我领导的团队正在这样做;我是一名资深科学家,与一支由化学家、生物学家和数据科学家组成的优秀团队一起领导一个寻找生物活性特征的项目。

对我来说,一个特别的时刻是“OMG”时刻,对我进入质谱领域做出了重大贡献,那就是在我本科期间,我有机会在阿姆斯特丹自由大学实习。

我的项目的核心是从细菌上清液中分离出一种抗微生物化合物,该化合物因其强大的抗结核活性而闻名。最初,我首先采用实验室内已经建立的方法。我的方法涉及手动收集级分并将其应用到琼脂平板上,在那里我观察到生长的抑制。

然而,在同一个实验室内,我可以看到对蛇毒进行复杂的三到四孔板测定。这些测定深入研究了血液凝固、肌肉收缩和类似复杂过程的抑制。我很快就决定在工作中尝试这些先进的方法。因此,我下定决心,开始升级我的抗微生物检测方法,以与这些复杂的方法保持一致。

随着实验的进展,我取得了重大突破。结果表现为独特且有影响力的生物活性痕迹,随后我将其与质谱信号相关联。

就在那时,我突然意识到,这些非常复杂的分析技术可以用来大海捞针。我想那是我的天啊时刻。这就是我爱上通过将生物测定与质谱相结合来解决这些难题的地方。

您能详细说明一下质谱分析样品的来源吗?您如何确定在该域内的搜索方向?

在 Enveda 旅程的早期阶段,我们仔细地搜索了文献,寻找表明特定植物对某些疾病的潜在功效的线索。

所以,确实,这就是事情的开始。我们齐心协力寻找非常具体的植物,但随着时间的推移,我们实际上已经扩大了我们的覆盖范围,覆盖了尽可能多的植物。我们只是在扩大我们的图书馆,以尽可能广泛地撒网,因为我们现在真正投资于可以识别这些生物活性分子(无论其来源如何)的平台。

关于您的旅程,您有什么有趣的历史事实吗?您还遇到过任何其他有趣的方面吗?

我们的首席执行官早些时候与我分享的一则轶事围绕着他在印度的成长经历。在那里期间,他患有导致黄疸的肝脏疾病。尽管咨询了许多医生,他的病情仍然持续。最终,一位家庭成员建议采用草药治疗,他最初对此持怀疑态度。然而,在尝试治疗后,黄疸逐渐消失。

尽管听起来几乎像是一种灵丹妙药,但我们观察到植物中含有如此多的生物活性化合物;我们只是还不知道这些化合物是什么。因此,谜团在于理解这些化合物——我们对它们存在的熟悉程度与我们对它们本质的有限了解形成鲜明对比。这才是 Enveda 真正开始的原因。
关于演讲者

Pelle Simpson 是 Enveda Biosciences 的高级科学家,他利用自己在分析化学、质谱和天然产物方面的专业知识来发现新药。他之前在阿姆斯特丹自由大学开发了小分子天然产物的分析方法,并在博尔德大学致力于发现抗癌机制。
他还是 3D 打印、CAD/CAM、CNC 和实验室自动化方面的专家,他利用这些技术开发药物发现的新工具和技术。佩尔热衷于利用自己的技能改变世界,并致力于寻找新的疾病治疗方法。

关于布鲁克生命科学质谱

探索将质谱分析应用于当今最紧迫的分析挑战的新方法。捕获离子淌度 (TIMS)、用于 MALDI-MS 成像的智能光束和扫描激光器等创新技术可提供真正的像素保真度,以及能够揭示同位素精细结构 (IFS) 特征的极分辨率 FTMS (XR) 技术,这些创新正在将科学探索推向新的高度。布鲁克的质谱解决方案使科学家能够取得突破性发现并获得更深入的见解。


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