根部区分：茯苓是真菌没有根叶的存在，是寄生在松类树木根部上面的，土茯苓为藤蔓植物，根部有明显的节状，伴随着小须根，叶子厚大而光滑；形状区分：茯苓呈现圆球状，外表黄棕色，里面为白色，土茯苓外表为黄褐色，里面为淡黄色。

一、根部的不同：

前者为菌类，不是植物，所以没有根的存在，是寄生在松类树木根部的真菌物质。

后者是藤蔓植物，有根叶等植物的特征，叶子厚大且光滑。根部形状为一节一节的，可以看到明显的节状，同时还有一些小须根长在上面。

二、形状的不同：

前者形状是圆形的或者长圆形的，呈现圆球状，外表上像甘薯一样，外表是黄棕色，切开之后可以看到里面的物质是白色的，类似于豆腐的颜色。

土茯苓虽然长相上与前者略微相似，外表颜色呈黄褐色，切开之后里面物质显示为淡黄色。