包皮细菌感染和真菌感染都是男性生殖器感染的常见问题。通常情况下，包皮细菌感染和真菌感染的区别有病因不同、症状不同、传播方式不同等。具体分析如下：

1.病因不同：细菌感染是由细菌引起的，而真菌感染是由真菌引起的。

2.症状不同：细菌感染通常会导致包皮、龟头、尿道等部位疼痛、瘙痒、排出分泌物等症状。而真菌感染则导致瘙痒、疼痛、瘙痒和灼热感等不适。

3.传播方式不同：细菌感染通常通过性接触等接触传播，而真菌感染主要通过与感染者皮肤接触或使用共享物品传播。

除以上原因外，还有其他的原因，如治疗方法不同、预防措施不同、并发症不同。如果出现上述感染，建议及时就医诊断，并根据医生的建议进行相应治疗和预防。应避免自行选择药物进行治疗，以免不当地使用导致病情加重或复杂化。